An den Professuren des DIRS werden die islamisch-religiösen Studien mit vier unterschiedlichen Schwerpunkten erforscht:

• Textwissenschaftlicher Schwerpunkt
• Systematischer Schwerpunkt
• Praktischer Schwerpunkt
• Pädagogischer Schwerpunkt

Weiterhin gibt es zwei Nachwuchsforschergruppen, die sich mit Normen, Normativität und Normenwandel sowie mit islamischen Gegenwartskulturen in Deutschland befassen.